CSS   发布时间:2022-04-17  发布网站:大佬教程  code.js-code.com
大佬教程收集整理的这篇文章主要介绍了pheatmap scale =“row”在hclust中给出错误(d,method = method):外部函数调用中的NA / NaN / Inf大佬教程大佬觉得挺不错的,现在分享给大家,也给大家做个参考。
我正在尝试用R中的包pheatmap创建一个带有基因表达值的热图.我已经多次使用该代码,直到今天仍然没有问题.看来当我做scale =“row”时,我最终得到了这个错误.我无法创建z分数.因此,可能某些行没有可变性,因此发生这种情况.我怎么能摆脱这个.矩阵具有1100行和9列.我的代码:
data  <- read.table("~path/DEGs_DESeq.txt",sep="\t")
data2 <- as.matrix(data[,2:9])
data3 <- data2[-1,]
samples <- data2[1,]
genes <- data[2:length(data2[,1]),1]
vett <- as.numeric(data3)
data4 <- matrix(vett,length(genes),length(samples),di@R_618_8156@s=list(paste(genes),paste(samples))) 
head(data4)

pheatmap(as.matrix(data4),col=bluered(200),scale="row",key=T,keysize=1.5,density.info="none",trace="none",cexCol=0.6,fontsize_row=8,fontsize_col=10)

hclust中的错误(d,method = method):
外国函数调用中的NA / NaN / Inf(arg 11)

我怎样才能摆脱这个错误?

解决方法

我实际上已经解决了..我必须在执行z分数计算时删除没有SD出现的行,并重建热图.谢谢

大佬总结

以上是大佬教程为你收集整理的pheatmap scale =“row”在hclust中给出错误(d,method = method):外部函数调用中的NA / NaN / Inf全部内容,希望文章能够帮你解决pheatmap scale =“row”在hclust中给出错误(d,method = method):外部函数调用中的NA / NaN / Inf所遇到的程序开发问题。

如果觉得大佬教程网站内容还不错,欢迎将大佬教程推荐给程序员好友。

本图文内容来源于网友网络收集整理提供,作为学习参考使用,版权属于原作者。
如您有任何意见或建议可联系处理。小编QQ:384754419,请注明来意。