大佬教程收集整理的这篇文章主要介绍了使用 R 从 file_name 中提取样本名称，大佬教程大佬觉得挺不错的，现在分享给大家，也给大家做个参考。
我的数据包含一个 file_name 列，其中 file_name 如下所示：
10300136747-X1-211181-XYZW-214-12D5-1_S81_mutect2_variants_joint.txt
我的目标是从中提取样本名称“X1-211181-XYZW”。我可以使用 R 中的什么函数来获得所需的结果？
您的问题令人困惑，但我仍然理解您想从文件“10300136747-X1-211181-XYZW-214-12D5-1_S81_mutect2_variants_joint.txt”中提取“样本名称”列。 如果是这样，那么您可以从文件 df1 中对列进行子集
samplename <- subset(df1,SELEct = c(3,5,14))
3,4,15是你的列号，你可以改成样品名列号
你也可以这样做
Samplename <- df1[,c(1,3:5)]
1,3,5 是您的列号，您可以将其更改为样品名称列号。
您可以使用 dput 函数使其成为由逗号或 data.frame 分隔的单行名称，以恢复到列。
,我认为您正在寻找的是正则表达式。您可以在 R 包 Stringr 中使用正则表达式。这是一个例子：
library(Stringr)
file_name <- "10300136747-X1-211181-XYZW-214-12D5-1_S81_mutect2_variants_joint.txt"
regex_Patten <- "[:alpha:]\\d-\\d{6}-[:alpha:]{4}"
str_extract(String = file_name,pattern = regex_Patten)
以上是大佬教程为你收集整理的使用 R 从 file_name 中提取样本名称全部内容，希望文章能够帮你解决使用 R 从 file_name 中提取样本名称所遇到的程序开发问题。
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