程序问答   发布时间:2022-06-02  发布网站:大佬教程  code.js-code.com
大佬教程收集整理的这篇文章主要介绍了在 R 中堆叠 .rds 文件大佬教程大佬觉得挺不错的,现在分享给大家,也给大家做个参考。

如何解决在 R 中堆叠 .rds 文件?

开发过程中遇到在 R 中堆叠 .rds 文件的问题如何解决?下面主要结合日常开发的经验,给出你关于在 R 中堆叠 .rds 文件的解决方法建议,希望对你解决在 R 中堆叠 .rds 文件有所启发或帮助;

我有多个 .rds 想要堆叠并另存为一个 .rds 文件。它们都有相同的分辨率。我使用这个函数来读取我的文件并且它起作用了。

SeaTurtles_IUCNdist <- List.files(path="RDS_SpecIEs/SeaTurtles/",pattern = "rds$",full.names = TRUE) %>%
  map_dfr(readRDS)

> class(SeaTurtles_IUCNdist)
[1] "sf"         "tbl_df"     "tbl"        "data.frame"

然而,当我使用函数 stack()

SeaTurtles_stack <- raster::stack(paste0("RDS_SpecIEs/SeaTurtles/",SeaTurtles_IUCNdist))

我不断收到此错误:

> SeaTurtles_stack <- raster::stack(SeaTurtles_IUCNdist,"RDS_SpecIEs/RasterStacks/AllSeaTurtles_IUCNdist.rds")
Error: Can't subset columns that don't exist.
x column `RDS_SpecIEs/RasterStacks/AllSeaTurtles_IUCNdist.rds` doesn't exist.

我不明白错误...我如何继续堆叠我的文件并保存它们?

解决方法

据我所知,你有这些 rds 文件。我不知道它们包含什么,但我知道 raster::stack 无法读取它们。

ff <- list.files(path="RDS_Species/SeaTurtles/",pattern = "rds$",full.names = TRUE)

可能有效的是读取它们然后使用 stack -- 假设 rds 文件包含有效的 RasterLayer(“valued 是这里的关键。通常不是可以安全地将 Raster* 对象保存到“rds”)

library(raster)
x <- lapply(ff,readRDS)
s <- stack(X)

大佬总结

以上是大佬教程为你收集整理的在 R 中堆叠 .rds 文件全部内容,希望文章能够帮你解决在 R 中堆叠 .rds 文件所遇到的程序开发问题。

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