使用 R 查询 SQLite 文件帮助：DBI::dbGetQuery() 永远不会完成，非常慢

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如何解决使用 R 查询 sqlite 文件帮助：DBI::dbGetQuery() 永远不会完成，非常慢？

我有一个 sqlite 文件，其中包含一个包含 900 万行左右和 30 多列的表。直到几天前，以下代码运行良好：

path <- file.path(basepath,"Rmark_web","sql_Data","2020Q3_Enterprise_Exposure_Wind.sqlite")
cn <- DBI::dbConnect(Rsqlite::sqlite(),path)
df <- DBI::dbGetquery(cn,"SELEct Longitude,Latitude,City,State,@R_637_10586@l_Value,GrIDID,new_LOB from [2020Q3_Enterprise_Exposure_Wind] where State in ('GA')")
DBI::dbdisconnect(cn)

当我在本地机器上运行包含此查询的代码时，它需要一些时间，但它确实完成了。我目前正在尝试使用以下指标在 docker 映像中运行它：

docker run --memory=10g --rm -d -p 8787:8787     -v /efs:/home/rstudio/efs     -e ROOT=TRUE     -e disABLE_AUTH=true     myrstudio        

有没有办法调试 Rsqlite 包？是否有另一种方法可以在不使用此包的情况下执行此查询？其余代码运行良好，但会在此特定步骤中停滞不前并且通常无法完成（尤其是当这段代码在 docker 映像中第二次或第三次运行时）。

查询中包含的状态数会随着运行而变化。

解决方法

library(RPOSTGRes)
library(RPOSTGReSQL)
library(DBI)
db <- 'airflow_db'  #provide the name of your db
    
host_db <- [omitted for privacy] 
    
db_port <- [omitted for privacy]  # or any other port specified by the DBA
    
db_user <- [omitted for privacy]  
    
db@R_197_3988@ <- Sys.getenv("DB_PASS")
    
con <- dbConnect(RPOSTGRes::POSTGRes(),dbname = db,host=host_db,port=db_port,user=db_user,password=db@R_197_3988@)
query <- paste('SELEct * from weather_report.ent_expo_data where "State" in (',in_states_clause,')',sep='')
print(query)
df <- dbGetQuery(con,query)

大佬总结

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