大佬教程收集整理的这篇文章主要介绍了为列的每个唯一值输出整行一次(Bash),大佬教程大佬觉得挺不错的,现在分享给大家,也给大家做个参考。
pep> AEYTCVAETK 2 genes ADUm.1024,ADUm.5198,ADUm.750 pep> AIQLTGK 1 genes ADUm.1999,ADUm.3560 pep> AIQLTGK 8 genes ADUm.1999,ADUm.3560 pep> KHEPPTEVDIEGR 5 genes ADUm.367 pep> VSSILEDKTT 9 genes ADUm.1192,ADUm.2731 pep> AIQLTGK 10 genes ADUm.1999,ADUm.3560 pep> VSSILEDKILSR 3 genes ADUm.2146,ADUm.5750 pep> VSSILEDKILSR 2 genes ADUm.2146,ADUm.5750
我想在第2列中为每个不同的肽值打印一行,这意味着上面的输入将成为:
pep> AEYTCVAETK 2 genes ADUm.1024,ADUm.2731 pep> VSSILEDKILSR 3 genes ADUm.2146,ADUm.5750
这是我到目前为止所尝试过的,但显然我也不需要:
awk '{print $2}' file | sort | uniq # Prints only the peptides... awk '{print $0,"\t",$1}' file |sort | uniq -u -f 4 # Altogether omits peptides which are not unique...
最后一点,它需要将作为其他肽的子串的肽作为不同的值处理(例如VSSILED和VSSILEDKILSR).谢谢 :)
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