大佬教程收集整理的这篇文章主要介绍了Linux下R包的安装位置逻辑,大佬教程大佬觉得挺不错的,现在分享给大家,也给大家做个参考。
各种R软件包的不同安装位置背后的逻辑是什么? 我似乎在我的Linux机器上安装了几个不同位置的软件包。 这是典型的行为,如果是这样的话,在/ usr / lib / R / library vs / usr / lib / R / site-library中安装软件包有什么理由? 我并不在乎软件包的安装位置,但是在我系统的不同位置安装这些软件看起来很愚蠢。
Renviron的注释如下,似乎表明/ usr / lib / R / site-library是Debian打包的软件包,但并没有真正解释其他两个目录的用途。 另外,通过在列表中设置最后@L_616_0@/ usr / lib / R /库不会使它不是install.packages()的默认目录?
# edd Apr 2003 Allow local install in /usr/local,also add a directory for # Debian packaged CRAN packages,and finally the default dir > .libPaths() [1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library" [3] "/usr/lib/R/library"
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马特,
你从特定的(Debian / Ubuntu)到通用(所有的Linux发行版)的概念是错误的。
这个特定的设置是由两个使用Debian的R Core成员向我推荐的(这是在Ubuntu之前)。 这不是@L_616_0@R范围的建议,这就是为什么你不能在手册中找到它的原因,而是R大功率用户在Debian和Debian系统上实现的特定建议。
基本的想法是
要保持完全忠实于/usr/ , /var/ ,…以便一方面由包管理系统 (例如apt-get , dpkg ,…)处理和/usr/local/...等等,这两者不能混用
这样/usr/local/lib/R/site-library获得.libPaths()发出的列表中的第@L_616_0@点,从而成为默认值,从而确保用户安装的软件包最终位于/usr/local/前一点
所以在/usr下面,我们在/usr/lib/R/library里面建立了R的推荐的打包(也包括在基本的R源文件中: boot , grid , lattice ,…),然后所有其他的软件包管理 r-cran-*软件包在/usr/lib/R/site-library 。 所以,例如r-cran-xml最终在那里,或者r-cran-zoo ,或者…
我仍然认为这个分割非常棒,这就是为什么我在Debian R软件包中维护这个设置的原因。
拥有所有用户的本地软件包是多用户操作系统上的@L_616_0@好主意。
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